Título: AVALIAÇÃO in silico DE PADRÕES MOLECULARES ASSOCIADOS AO DANO (DAMPs) E SEUS RECEPTORES EM SERES HUMANOS.

Título alternativo: In silico ASSESSMENT OF DAMAGE ASSOCIATED MOLECULAR PATTERNS (DAMPs) AND THEIR RECEPTORS HUMANS.

Autoria de: Rebeca Louise de Araujo Barboza

Orientação de: Ana Paula Peconick

Presidente da banca: Ana Paula Peconick

Primeiro membro da banca: Erika Aparecida Oliveira

Segundo membro da banca: Wanderley José Mantovani Bittencourt

Palavras-chaves: Bioinformática, Doenças, mRNA, Sistema imunológico, DAMPs

Data da defesa: 18/11/2019

Semestre letivo da defesa: 2019-2

Data da versão final: 02/12/2019

Data da publicação: 02/12/2019

Referência: Barboza, R. L. d. A. AVALIAÇÃO in silico DE PADRÕES MOLECULARES ASSOCIADOS AO DANO (DAMPs) E SEUS RECEPTORES EM SERES HUMANOS.. 2019. 63 p. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas Bacharelado)-Universidade Federal de Lavras, Lavras, 2019.

Resumo: Os Padrões Moleculares Associados ao Dano (Damps)são moléculas intracelulares lançadas ao meio extracelular após ocorrer uma lesão celular e são reconhecidas por receptores de reconhecimento de padrão (PRRs), que ativam o sistema imune inato. Existem vários tipos de PRRs, entre eles temos os Receptores Toll-like (TLRs). Encontram-se diretamente envolvidas na etiopatogenia de doenças crônicas tais como câncer, diabetes, hepatopatias, cardiopatias e também doenças neurodegenerativas. O presente trabalho teve como objetivo acompanhar o desenvolvimento de um projeto na pesquisa por diferentes DAMPs humanos e seus receptores que apresentaram potencial de determinar sequências alvos que possam vir a ser utilizadas para uma avaliação do prognóstico de doenças ou ainda como moduladores na resposta imunológica. Foram realizadas revisões bibliográficas e pesquisa em bancos de dados públicos para sequências nucleotídicas, foram feitas predições de mRNA secundários através de softwares online, e também realizou-se a predição de antigenicidade de epítopos de todas as sequências encontradas, através do ImmuneEpitopeDatabaseAnalysisResource, analisou-se também a similaridade entra mamíferos na qual se utilizou a ferramenta de plataforma BLAST, também realizou-se os desenhos de marcadores que foram desenhados a partir das sequências de mRNA que apresentaram a melhor predição de estrutura secundária, o software utilizado foi o Primer-BLAST. Foi realizada a triagem de sequências de aminoácidos (mRNA) dos DAMPs e de seus receptores onde foram gerados um total de 178 sequências 24 sequências TLRs, 122 sequências HSP, e 32 sequências S100. Foram selecionados iniciadores que amplificam essas sequências nas melhores condições para se trabalhar como um marcador ou modulador imune.

Abstract: Damage Associated Molecular Patterns (Damps) are intracellular molecules released into the extracellular environment after cell damage occurs and are recognized by pattern recognition receptors (PRRs), which activate the innate immune system. There are several types of PRRs, among them are Toll-like Receptors (TLRs). They are directly involved in the etiopathogenesis of chronic diseases such as cancer, diabetes, liver disease, heart disease and also, neurodegenerative diseases. The present work aimed to follow the development of a research project for different human DAMPs and their receptors that have the potential to determine target sequences that may be used for an evaluation of disease prognosis or as modulators in the immune response. Bibliographic reviews and searches in public databases for nucleotide sequences were performed, secondary mRNA predictions were made through online software, and the antigenicity of epitopes of all sequences found was also predicted using ImmuneEpitopeDatabaseAnalysisResource. Also, the similarity between mammals in which the BLAST platform tool was used, we also made the marker designs that were drawn from the mRNA sequences that presented the best prediction of secondary structure, the software used was Primer-BLAST. Amino acid sequences (mRNAs) were screened from DAMPs and their receptors where a total of 178sequences were generated 24 TLRs sequences, 122 HSP sequences, and 32 S100 sequences. Primers were selected that amplify these sequences under the best conditions to work as a marker or immune modulator. Primer pairs have already been designed and are ready to be used for in vitro assays in future studies.

URI: sip.prg.ufla.br/publico/trabalhos_conclusao_curso/acessar_tcc_por_curso/
ciencias_biologicas_bacharelado/20192201410721

URI alternaviva: repositorio.ufla.br/handle/1/44413

Curso: G012 - CIÊNCIAS BIOLÓGICAS (BACHARELADO)

Nome da editora: Universidade Federal de Lavras

Sigla da editora: UFLA

País da editora: Brasil

Gênero textual: Trabalho de Conclusão de Curso

Nome da língua do conteúdo: Português

Código da língua do conteúdo: por

Licença de acesso: Acesso aberto

Nome da licença: Licença do Repositório Institucional da Universidade Federal de Lavras

URI da licença: repositorio.ufla.br

Termos da licença: Acesso aos termos da licença em repositorio.ufla.br

Detentores dos direitos autorais: Rebeca Louise de Araujo Barboza e Universidade Federal de Lavras

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