Título: ESTUDOS IN SILICO DE POTENCIAIS INIBIDORES DA PROTEASE DO SARS-CoV-2

Título alternativo: IN SILICO STUDIES OF POTENTIAL INHIBITORS OF SARS-COV-2 PROTEASE

Autoria de: Henrique Fernandes Silva

Orientação de: Elaine Fontes Ferreira da Cunha

Coorientação de: Alexandre Alves de Castro

Presidente da banca: Elaine Fontes Ferreira da Cunha

Primeiro membro da banca: Teodorico de Castro Ramalho

Segundo membro da banca: Paulo Ricardo da Silva

Palavras-chaves: SARS-CoV, SARS-CoV-2, Mpro, Química computacional, Docking molecular

Data da defesa: 08/12/2023

Semestre letivo da defesa: 2023-2

Data da versão final: 13/12/2023

Data da publicação: 13/12/2023

Referência: Silva, H. F. ESTUDOS IN SILICO DE POTENCIAIS INIBIDORES DA PROTEASE DO SARS-CoV-2. 2023. 77 p. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Química Licenciatura Plena)-Universidade Federal de Lavras, Lavras, 2023.

Resumo: Em 2019, na cidade de Wuhan, na China, um novo coronavírus (SARS-CoV-2) foi identificado e estabelecido como uma potencial ameaça global. O vírus se espalhou rapidamente e culminou em uma pandemia mundial a partir do ano de 2020. Para o combate ao novo coronavírus, diversos cientistas e pesquisadores trabalharam incansavelmente até produzirem dados suficientes para inibir a atividade viral. A Mpro (Main Protease ???????? Protease Principal) do SARS-CoV-2 desempenha um papel fundamental no ciclo de replicação viral e é um alvo potencial para o desenvolvimento de inibidores. Para essa tarefa, os métodos computacionais podem contribuir efetivamente para descobertas e desenvolvimento de novos medicamentos para o combate ao vírus. Trabalhos e publicações anteriores a respeito da inibição da atividade viral do SARS-CoV serviram de base para o estudo de compostos com atividade inibitória contra a Mpro do SARS-CoV-2, uma vez que o alinhamento das sequências das duas enzimas Mpro possui uma similaridade de 86,125. O Docking Molecular foi realizado com o software Molegro Virtual Docker (MVD®). Os resultados obtidos mostraram que os biflavonóides de Torreya nucifera apresentaram melhor energia de interação intermolecular para Mpro do SARS-CoV e SARS-CoV-2. Neste caso, três ligantes (2l, 2m e 2n) apresentaram energia de interação intermolecular de ????????235.09 kcal mol-1, ????????223.42 kcal mol-1 e ????????222.39 kcal mol-1, respectivamente, para SARS????????CoV. De maneira semelhante, esses ligantes apresentaram energia de interação de ????????228.89 kcal mol-1, ????????225.10 kcal mol-1e ????????234.62 kcal mol-1, respectivamente, para SARS-CoV-2. Os resultados do trabalho indicam que os potenciais inibidores da Mpro do SARS-CoV podem ser efetivos contra a Mpro do SARS-CoV-2. Portanto, os resultados deste trabalho se mostram relevantes e poderão servir de base para futuros projetos visando a atividade viral do SARS-CoV-2.

Abstract: In 2019, in the city of Wuhan, China, a new coronavirus (SARS-CoV-2) was identified and established as a potential global threat. The virus spread rapidly and culminated in a worldwide pandemic starting in 2020. To combat the novel coronavirus, several scientists and researchers have worked tirelessly until they have produced enough data to inhibit viral activity. The Mpro (Main Protease) of SARS-CoV-2 plays a key role in the viral replication cycle and is a potential target for the development of inhibitors. For this task, computational methods can effectively contribute to the discovery and development of new drugs to combat the virus. Previous work and publications on the inhibition of SARS-CoV viral activity served as a basis for the study of compounds with inhibitory activity against the Mpro of SARS-CoV-2, since the alignment of the sequences of both Mpro enzymes has a similarity of 86.125. Molecular docking was carried out using the Molegro Virtual Docker (MVD®) software. The results showed that Torreya nucifera biflavonoids showed the best intermolecular interaction energy for Mpro of SARS-CoV and SARS-CoV-2. In this case, three ligands (2l, 2m e 2n) showed intermolecular interaction energies of ????????235.09 kcal mol-1, ????????223.42 kcal mol-1 and ????????222.39 kcal mol-1, respectively, for SARS-CoV. Similarly, these ligands showed interaction energies of ????????228.89 kcal mol-1, ????????225.10 kcal mol-1 and ????????234.62 kcal mol-1, respectively, for SARS-CoV-2. The results of this work indicate that potential inhibitors of the SARS-CoV Mpro may be effective against the Mpro of SARS-CoV-2. Therefore, the results of this work are relevant and could serve as a basis for future projects targeting the viral activity of SARS-CoV-2.

URI: sip.prg.ufla.br/publico/trabalhos_conclusao_curso/acessar_tcc_por_curso/
quimica_licenciatura/20232201910375

URI alternaviva: sem URI do Repositório Institucional da UFLA até o momento.

Curso: G013 - QUÍMICA (LICENCIATURA PLENA)

Nome da editora: Universidade Federal de Lavras

Sigla da editora: UFLA

País da editora: Brasil

Gênero textual: Trabalho de Conclusão de Curso

Nome da língua do conteúdo: Português

Código da língua do conteúdo: por

Licença de acesso: Acesso aberto

Nome da licença: Licença do Repositório Institucional da Universidade Federal de Lavras

URI da licença: repositorio.ufla.br

Termos da licença: Acesso aos termos da licença em repositorio.ufla.br

Detentores dos direitos autorais: Henrique Fernandes Silva e Universidade Federal de Lavras

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